Die erste Kirche wurde 1021 geweiht, jedoch bereits 1117 durch ein Erdbeben zerstört. Bischof Otto der Heilige ließ daraufhin einen monumentalen romanischen Neubau errichten. Nach weiteren Schäden und einem Brand im Jahr 1610 erhielt die Kirche im Zuge des Wiederaufbaus ihr heutiges Erscheinungsbild.
Sehenswert sind vor allem die barocke Kirchenfassade mit ihrer beeindruckenden Freitreppe, das Grabmal des Heiligen Otto und das neugotische Netzgewölbe. Höhepunkt im Inneren der Kirche ist der „Himmelsgarten“, ein Deckengemälde mit über 570 detailreich dargestellten Blumen und Heilkräutern. Dieses außergewöhnliche Deckengemälde ist weltweit einzigartig und zählt zu den bedeutendsten Kunstwerken der Stadt.
Die Klosterkirche St. Michael ist ab dem 26. April freitags bis sonntags sowie an Feiertagen jeweils von 11 bis 16 Uhr geöffnet.
